“Giả thuyết hydrogenosome” giải thích hành vi sinh thành nguyên thủy này trong cây phát sinh của mọi sinh vật nhân thực bằng sự hợp nhất giữa vi khuẩn thật (vi khuẩn alpha-proteobacteria) với một cổ khuẩn. Cổ khuẩn đã hưởng lợi từ sự khuếch tán hiđrô qua màng của vi khuẩn alpha-proteobacteria vào tế bào chất của cổ khuẩn.”